Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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GTF2H2Q13888 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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GTF2H2Q13888 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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GTF2H2Q13888 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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GTF2H2Q13888 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H2Q13888 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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