Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTCH1Q13635 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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