Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms