Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCGB2A2Q13296 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms