Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEMA3FQ13275 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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