Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DUSP4Q13115 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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