Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRDM2Q13029 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms