Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RAB40BQ12829 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RAB40BQ12829 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RAB40BQ12829 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RAB40BQ12829 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RAB40BQ12829 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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