Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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KCNMA1Q12791 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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KCNMA1Q12791 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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KCNMA1Q12791 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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KCNMA1Q12791 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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KCNMA1Q12791 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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KCNMA1Q12791 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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KCNMA1Q12791 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNMA1Q12791 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNMA1Q12791 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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