Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms