Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms