Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN5Q08AF3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms