Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms