Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms