Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEUP1Q05D60 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms