Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP7AQ04656 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP7AQ04656 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms