Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GBE1Q04446 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms