Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F1Q03052 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F1Q03052 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms