Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCNT1Q02742 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCNT1Q02742 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms