Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC6A3Q01959 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms