Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms