Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK3Q00526 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms