Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTF2BQ00403 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms