Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTG1P63261 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms