Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63132 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms