Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK-16P61578 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK-16P61578 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK-16P61578 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms