Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVK11-1P61568 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms