Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms