Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms