Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NKX2-5P52952 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms