Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRCA2P51587 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms