Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB28P51157 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB28P51157 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB28P51157 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms