Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms