Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ETV4P43268 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ETV4P43268 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ETV4P43268 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV4P43268 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV4P43268 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV4P43268 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV4P43268 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ETV4P43268 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ETV4P43268 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms