Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG3P32926 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG3P32926 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG3P32926 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG3P32926 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG3P32926 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG3P32926 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG3P32926 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG3P32926 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG3P32926 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG3P32926 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms