Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-FP30511 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-FP30511 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms