Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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