Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHMP24386 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHMP24386 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHMP24386 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHMP24386 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms