Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A1P23297 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A1P23297 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A1P23297 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A1P23297 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A1P23297 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A1P23297 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A1P23297 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
S100A1P23297 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
S100A1P23297 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms