Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT1P21579 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT1P21579 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT1P21579 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT1P21579 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT1P21579 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT1P21579 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT1P21579 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT1P21579 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT1P21579 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT1P21579 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT1P21579 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms