Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD247P20963 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms