Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF1P18846 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATF1P18846 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms