Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTPS1P17812 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms