Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUP10909 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUP10909 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUP10909 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUP10909 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUP10909 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLUP10909 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLUP10909 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLUP10909 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CLUP10909 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLUP10909 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLUP10909 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLUP10909 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLUP10909 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLUP10909 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLUP10909 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms