Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI4P10075 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms