Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NGFRP08138 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NGFRP08138 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NGFRP08138 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms