Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MSMBP08118 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MSMBP08118 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MSMBP08118 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MSMBP08118 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MSMBP08118 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MSMBP08118 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MSMBP08118 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MSMBP08118 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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MSMBP08118 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MSMBP08118 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MSMBP08118 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSMBP08118 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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