Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL3A1P02461 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL3A1P02461 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms