Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG7O95352 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG7O95352 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG7O95352 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG7O95352 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG7O95352 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms