Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABARAPO95166 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms